- Morálka a užitočnosť (1891):Thomson v tejto knihe tvrdí, že morálka je založená na užitočnosti alebo princípe maximalizácie šťastia a minimalizácie bolesti. Obhajuje tento postoj proti rôznym kritikám, vrátane obvinenia, že vedie k egoizmu a že nemôže vysvetliť morálny význam niektorých činov.
- Utilitariánska teória práva (1893):Thomson v tomto diele aplikuje princíp užitočnosti na filozofiu práva. Tvrdí, že zákon by mal byť navrhnutý tak, aby podporoval čo najväčšie šťastie čo najväčšieho počtu ľudí a že tento princíp by sa mal použiť na výklad a hodnotenie právnych pravidiel a rozhodnutí.
- Politická etika (1895):Thomson v tejto knihe rozoberá etické základy politických inštitúcií. Tvrdí, že štát je oprávnený ako prostriedok na podporu ľudského blahobytu a že najlepšia forma vlády je taká, ktorá najefektívnejšie dosahuje tento cieľ.
- Problém zla (1910):Thomson v tomto diele rieši otázku, prečo je na svete zlo, ak existuje Boh. Tvrdí, že zlo nie je v rozpore s existenciou dobrotivého Boha a že ho možno vysvetliť princípom slobodnej vôle a obmedzenosti ľudských bytostí.
- História antickej filozofie (1921):Táto kniha poskytuje ucelený prehľad dejín filozofie od starovekých Grékov až po stredovek. Thomson diskutuje o hlavných filozofoch a filozofických hnutiach tohto obdobia a analyzuje ich príspevky k filozofii.
Toto je len niekoľko diel, ktoré napísal Francis Paul Thompson. Bol plodným spisovateľom a jeho diela mali významný vplyv na rozvoj morálnej a politickej filozofie.