Najstaršie bongá boli pravdepodobne vyvinuté zotročenými Afričanmi na Kube, ktorí ich používali na vytváranie hudby a vyjadrovanie sa. Postupom času sa bongá stali základom kubánskych hudobných žánrov ako son, rumba a salsa. Boli prijaté aj inými krajinami Latinskej Ameriky a nakoniec sa rozšírili po celom svete.
Bongo bicie zohrali významnú úlohu vo vývoji rôznych hudobných štýlov, vrátane jazzu a latin jazzu. Začiatkom 20. storočia uviedli bongá do jazzovej hudby slávni perkusionisti ako Chano Pozo a Tito Puente. Stali sa obľúbeným nástrojom v rôznych jazzových kapelách a prispeli k spojeniu jazzových a latinských rytmov.
V Spojených štátoch si bongá získali popularitu počas 50. a 60. rokov minulého storočia ako súčasť explózie latinskej hudby. Objavili sa v hudbe umelcov ako Tito Puente, Machito a Celia Cruz. Bongo si našli cestu aj do rockovej a popovej hudby, kde boli zvyknutí pridať do skladieb perkusívny prvok.
Dnes sú bonga základným nástrojom v mnohých hudobných žánroch vrátane latinskej hudby, jazzu a rôznych foriem populárnej hudby. Bežne sa používajú v bicích súboroch a sú začlenené aj do hudobných vzdelávacích programov po celom svete.
História bongo bubnov je dôkazom ich všestrannosti, výraznosti a schopnosti spájať ľudí prostredníctvom hudby. Sú symbolom kultúrnej výmeny, kreativity a bohatých tradícií afro-kubánskej hudby.