1. Doslovné bratstvo: Toto sa týka spojenia medzi Edwardom a Alphonsom Elricom , dvaja hlavní protagonisti. Sú skutočnými bratmi a ich vzťah je jadrom príbehu. Sú si hlboko oddaní, ochotní obetovať všetko pre dobro toho druhého.
2. Filozofické bratstvo: Séria skúma myšlienku bratstva presahujúceho pokrvné putá . Vidno to na vzťahoch medzi:
* Edward a Roy Mustang: Zdieľajú vzájomný rešpekt a zmysel pre kamarátstvo, spolupracujú na spoločných cieľoch.
* Alphonse a homunculi: Alphonse je chiméra vytvorená prostredníctvom alchýmie. Nachádza spojenie s homunculi, umelými bytosťami vytvorenými rovnakým procesom, spoznáva ich spoločné skúsenosti a zápasy.
* The Elrics a ďalšie postavy: Vytvárajú si putá s rôznymi jednotlivcami, často sa stávajú náhradnými rodinnými príslušníkmi vo svete, ktorý im spôsobuje obrovské utrpenie.
3. "Bratstvo človeka": Séria tiež skúma koncept ľudského spojenia a zdieľanej ľudskosti aj napriek obrovským rozdielom. Táto téma je výrazná v druhej polovici príbehu, keďže Elricovci čelia nebezpečenstvám izolácie a predsudkov. Učia sa, že každý, bez ohľadu na svoj pôvod alebo presvedčenie, má potenciál pre dobro aj zlo.
4. Bratstvo alchýmie: Alchýmia je prezentovaná ako mocný nástroj, ktorý možno použiť na dobro aj zlo . Prenasledovanie Elricovho kameňa mudrcov, mocného alchymistického objektu, odhaľuje nebezpečenstvo honby za mocou bez zváženia etických dôsledkov. Séria vyvoláva otázky o zodpovednosti alchymistov a limitoch ich moci.
5. Dôležitosť obety: Bratstvo je často skúšané skutkami obetovania , čím demonštrujú hĺbku ich oddanosti jeden druhému a svojim ideálom. Elrici často riskujú svoje životy jeden pre druhého a pre blaho ostatných.
V súhrne je bratstvo vo Fullmetal Alchemist komplexnou a viacvrstvovou témou, ktorá predstavuje silu spojenia, dôležitosť zdieľanej ľudskosti a zodpovednosť, ktorá prichádza s ovládaním moci. Je to ústredná téma, ktorá poháňa dej a postavy príbehu a zanecháva na divákov trvalý vplyv.