Existuje však niekoľko komplikácií:
* Stratené diela: Mnohé z jeho diel sa stratili v čase, boli zničené alebo sú stále neobjavené.
* Spolupráca: Van Eyck pravdepodobne spolupracoval so svojou dielňou, takže niektoré obrazy, ktoré mu boli pripisované, mohli vytvoriť asistenti.
* Pripisy: O niektorých dielach sa medzi historikmi umenia diskutuje, či ich namaľoval iba Van Eyck alebo ich čiastočne namaľoval jeho diel.
Takže aj keď máme rozumnú predstavu o jeho prežívajúcej práci, skutočný počet obrazov, ktoré vytvoril, zostáva záhadou.