Séguy sa narodil v Toulone vo Francúzsku 1. júla 1877. Už v mladom veku prejavil vášeň pre prírodopis a vo veku 12 rokov začal zbierať hmyz. Vyštudoval medicínu na univerzite v Montpellier a v roku 1902 promoval.
Séguy začal svoju kariéru ako vojenský lekár, no čoskoro sa začal venovať entomológii. Od roku 1906 až do svojho odchodu do dôchodku v roku 1942 pracoval v Muséum national d'histoire naturelle v Paríži. Počas svojho pôsobenia v múzeu bol kurátorom zbierky Diptera a publikoval množstvo vedeckých článkov a kníh na túto tému.
Hlavnou oblasťou Séguyho výskumu bola čeľaď Muscidae a stal sa svetovým expertom na túto skupinu. Opísal viac ako 1000 nových druhov Muscidae a publikoval niekoľko monografií a katalógov o čeľade. Pracoval aj na iných čeľadiach Diptera, vrátane Tephritidae, Conopidae a Cecidomyiidae.
Okrem vedeckej práce bol Séguy aj aktívnym členom viacerých vedeckých spoločností, vrátane Société entomologique de France a Kráľovskej entomologickej spoločnosti v Londýne. V roku 1939 mu bola udelená Linneanova medaila od Linnean Society of London a v roku 1949 Prix Constant od Akadémie des sciences v Paríži.
Séguy zomrel v Paríži 23. októbra 1951 vo veku 74 rokov. Bol to plodný entomológ, ktorý významne prispel k štúdiu dvojkrídlovcov a jeho práca je dodnes vedcami často citovaná.