Jeho smrť bola výsledkom popravy popravnou čatou , ktorú nariadila boľševická vláda. Oficiálna príčina smrti bola uvedená ako "poprava zastrelením", hoci existujú protichodné účty a teórie o konkrétnych okolnostiach. Niektoré správy naznačujú, že rodina bola zastrelená zblízka, zatiaľ čo iní tvrdia, že boli najprv zastrelení a potom dobití bajonetmi.
Je dôležité poznamenať, že okolnosti týkajúce sa popravy rodiny Romanovcov sú stále predmetom diskusií a sporov. Niektorí historici tvrdia, že poprava bola nevyhnutným aktom na zabránenie kontrarevolúcii, iní ju považujú za brutálnu a neopodstatnenú vraždu. Bez ohľadu na interpretáciu zostáva poprava cára a jeho rodiny významnou historickou udalosťou, ktorá sa naďalej skúma a diskutuje.