Ako sa však príbeh vyvíja, napätie vzniká, keď vybraná skupina prasiat začne manipulovať a vykorisťovať svoje zvieratá. Konflikt sa zintenzívni, keď prasatá, vedené prefíkaným a autoritárskym kancom Napoleonom, začnú upravovať Sedem prikázaní – hlavné princípy farmy – aby slúžili ich vlastným záujmom.
Napoleon a jeho prasatá postupne preberajú vedúce úlohy a vytvárajú hierarchický systém, ktorý ich stavia nad ostatné zvieratá. To vedie k hlbokej priepasti v rámci komunity zvierat, pretože Napoleon a jeho nohsledi si užívajú privilégiá a luxus, zatiaľ čo ostatné zvieratá sa usilujú o údržbu farmy.
Konflikt sa točí okolo honby prasiat po moci a boja ostatných zvierat o udržanie ideálov ich počiatočnej rebélie. Skúmanie výziev pri presadzovaní skutočnej rovnosti zo strany Animal Farm sa v konečnom dôsledku stáva kritikou totalitných spoločností a korupcie zdanlivo vznešených ideológií.