- Pokémon Diamond obsahuje Dialga, pokémona typu oceľ/draka, ktorý predstavuje čas.
- Perla Pokémona obsahuje Palkiu, pokémona typu voda/draka, ktorý predstavuje vesmír.
Aj keď obe hry ponúkajú podobné zážitky, tu je niekoľko kľúčových rozdielov medzi nimi:
Exkluzívny Pokémon :
* Pokémon Diamond :Stunky, Glameow, Drifloon, Murkrow, Misdreavus,
Sneasel, Scyther, Heracross, Skarmory, Houndoom
* Perla Pokémona :Budew, Roselia, Roserade, Cranidos, Shieldon,
Bonsly, Mime Jr., Weavile, Murkrow, Misdreavus, Gligar, Elekid
Legendárny pokémon :
* Pokémon Diamond :Dialga
* Perla Pokémona :Palkia
Ďalšie rozdiely:
- Niektoré menšie rozdiely v dialógoch, dizajne postáv a dejových udalostiach.
- Mierne odlišná dostupnosť TM a skrytých pohybov
Celkovo obe hry poskytujú presvedčivé zážitky a v konečnom dôsledku je voľba medzi Pokémon Diamond a Pokémon Pearl záležitosťou preferencií.