Existujú dôkazy, ktoré naznačujú, že cisárske rezy mohli byť vykonávané v staroveku. Staroveký grécky lekár Hippokrates napríklad písal o procedúre zvanej „embryotómia“, ktorá zahŕňala rozrezanie maternice a vybratie dieťaťa. Nie je však jasné, či bola embryotómia niekedy skutočne vykonaná, a je možné, že Hippokrates iba špekuloval.
Prvý zdokumentovaný prípad úspešného cisárskeho rezu vykonal v roku 1500 švajčiarsky lekár Jacob Nufer. Nuferovou pacientkou bola žena menom Elisabeth Strüb, ktorá trpela stavom nazývaným ruptúra maternice. Nufer úspešne odobrala dieťa zo Strübovho lona a matka aj dieťa prežili.
V storočiach od Nuferových čias sa cisárske rezy stávajú čoraz bežnejšími. Dnes sa cisárske rezy vykonávajú pri približne 30 % všetkých pôrodov v USA.