Vyskytlo sa však niekoľko prípadov, keď bol považovaný za mŕtveho vrátane:
* Príbeh „Smrť Spider-Mana“ (1992 – 1993): Tento neslávne známy príbeh videl Spider-Mana zdanlivo zabitého Zeleným Goblinom. Neskôr sa však ukázalo, že Goblin skutočne zabil klon Spider-Mana a skutočný Peter Parker bol stále nažive.
* Príbeh „One More Day“ (2007): Tento príbeh videl Spider-Mana uzavrieť dohodu s diablom Mefistom, aby zachránil život tete May. V dôsledku toho bolo jeho manželstvo s Mary Jane Watson vymazané z existencie a Spider-Man zostal zdanlivo sám a bez rodiny.
Zatiaľ čo tieto udalosti boli hlavnými zlomovými bodmi v živote Spider-Mana, nakoniec prežil a pokračoval vo svojich dobrodružstvách.
Je dôležité poznamenať, že v Marvel Comics boli alternatívne reality a vesmíry, kde Spider-Man zomrel, ale tieto udalosti sa nevzťahujú na hlavnú kontinuitu.