Zažil však niekoľko zážitkov na prahu smrti a bol zabitý v alternatívnych časových líniách a príbehoch :
* The Clone Saga (1994-1996): Tento neslávne známy príbeh videl Spider-Mana zdanlivo zomrieť a nahradiť ho klonom, hoci sa nakoniec ukázalo, že ide o podvod.
* „Ešte jeden deň“ (2007): V tomto príbehu sa Spider-Man dohodne s Mefistom, aby zachránil tete May život, ale za cenu vymazania jeho manželstva s Mary Jane Watsonovou.
* Smrť Spider-Mana (2004): Toto bola samostatná kontinuita mimo hlavného Marvel Universe, kde Spider-Mana zabil Green Goblin.
* "Spider-Man:Reign" (2007): Táto budúca časová os videla staršieho unaveného Spider-Mana zomrieť po poslednej bitke so Zeleným Goblinom.
Je dôležité poznamenať, že toto sú špecifické prípady a nevzťahujú sa na hlavný Marvel Universe. Zatiaľ čo Spider-Man čelil mnohým výzvam a tragédiám, naďalej je ikonickým hrdinom vo vesmíre Marvel.