* Národná historická asociácia Thomasa Painea: Táto organizácia podporuje štúdium Paineovho života a diela. Organizujú podujatia, publikujú materiály a udržiavajú národné historické miesto Thomas Paine v New Rochelle v New Yorku.
* Inštitút Thomasa Painea: Táto organizácia propaguje Paineove myšlienky individuálnej slobody, demokracie a sociálnej spravodlivosti prostredníctvom vzdelávacích programov, publikácií a verejných podujatí.
* Národný historický park Thomasa Painea: Tento park sa nachádza v New Rochelle v New Yorku a pripomína život a prácu Thomasa Painea. Nachádza sa v ňom chata Thomasa Painea, jeho bývalá rezidencia, a múzeum s exponátmi o jeho živote a spisoch.
Aj keď neexistuje žiadna cena špeciálne venovaná Thomasovi Paineovi, jeho odkaz je ctený a udržiavaný prostredníctvom práce týchto a iných organizácií.