Dobro vs. zlo: Román skúma klasickú tému dobra proti zlu, ktorú predstavujú Sherlock Holmes a pes. Holmes stelesňuje silu rozumu a dedukcie, zatiaľ čo Hound symbolizuje sily temnoty a povery.
Ľudský stav: Román sa tiež ponorí do ľudského stavu, najmä do tém strachu, viny a vykúpenia. Sira Henryho Baskervilla prenasleduje rodinná kliatba, zatiaľ čo Dr. Mortimer zápasí s pocitom viny za smrť sira Charlesa Baskervilla. Holmes však predstavuje víťazstvo ľudského intelektu nad poverami a strachom.