* 1567: Po smrti svojho manžela Lorda Darnleyho a svadbe s grófom z Bothwellu bola Mária nútená vzdať sa škótskeho trónu a uväznená na hrade Lochleven .
* 1568: Utiekla z hradu Lochleven, ale bola porazená v bitke pri Langside a utiekla do Anglicka, kde bola uväznená po zvyšok svojho života. Spočiatku bola držaná na zámku Carlisle.
* 1568-1572: Bola premiestnená na Bolton Castle a potom na Sheffield Castle.
* 1572-1587: Mary bola premiestnená na hrad Tutbury, Wingfield Manor, Coventry, Chatsworth House a nakoniec na hrad Fotheringhay, kde bola súdená a popravená v roku 1587.
Je dôležité poznamenať, že nie vždy bola držaná v drsných podmienkach. Niektoré z jej väzení boli pohodlnejšie ako iné, v závislosti od miesta a politickej klímy. Vždy ju však prísne strážili a slobodu už nikdy nezískala.