V hre je 25 rôznych charakterov, z ktorých každá má svoje pozitívne a negatívne účinky na konkrétne štatistiky. Napríklad Pokémon s tvrdou povahou nemá žiadne úpravy štatistík, zatiaľ čo jeden s veselou povahou má zvýšenú rýchlosť a zníženie špeciálneho útoku.
Pochopenie a správa prírody je rozhodujúca pri budovaní efektívneho tímu Pokémonov, pretože môžu ovplyvniť celkové silné a slabé stránky Pokémonov. Hráči sa môžu stretnúť a naverbovať Pokémonov so špecifickými povahami pri skúmaní dungeonov alebo pomocou funkcie Wonder Mail na spojenie s ostatnými hráčmi.