Takto funguje systém Shadow Pokémon v Xenogears:
1. Omdlenie tieňového pokémona: Shadow Pokémonov môžete v bitkách omdlievať, rovnako ako každého iného nepriateľa. Toto ich vlastne „nezachytáva“.
2. Skutočný význam slova „Zachytenie“: Akt „zachytenia“ Shadow Pokémona v Xenogears znamená poraziť ho v boji a potom vstrebať ich energiu a spomienky do vlastných postáv . To sa deje pomocou schopnosti "Zachytiť" , ktorý je dostupný pre určité postavy.
3. Schopnosť „zachytiť“: Schopnosť „Zachytiť“ nie je niečo, čo sa naučíte alebo kúpite; je to súčasť prirodzených schopností postavy. Keď postava môže použiť schopnosť „Capture“, budete môcť vidieť špeciálny príkaz počas bitky po porážke Shadow Pokémona. Použitie tohto príkazu vám umožní absorbovať ich energiu a spomienky.
Preto nemôžete opäť "chytiť" vyblednutého Shadow Pokémona. Keď porazíte Shadow Pokémona, buď ho absorbujete (prostredníctvom Capture), alebo bude navždy preč.
Herní dizajnéri si pravdepodobne vybrali tento systém, aby zdôraznili témy straty, obety a boja proti temnote, ktoré sú ústredné v Xenogearsovom rozprávaní.