* Spustenie tlače: Niektoré karty boli vytlačené vo veľmi obmedzenom množstve, ako napríklad propagačné karty alebo karty vydávané pri konkrétnych udalostiach.
* Podmienka: Stav karty výrazne ovplyvňuje jej vzácnosť. Nedotknutá karta v bezchybnom stave bude oveľa vzácnejšia ako ťažko hraná alebo poškodená.
* Vydanie: Rôzne výtlačky tej istej karty môžu mať rôzne rarity, pričom skoršie vydania sú často vyhľadávanejšie.
* Dopyt: Popularita karty a zberateľský záujem môžu tiež ovplyvniť jej vnímanú vzácnosť.
Tu je však niekoľko kariet, ktoré sa často považujú za najvzácnejšie:
* Súprava „Legendárna exodia“: Táto sada piatich kariet je notoricky vzácna, najmä karta „Exodia the Forbidden One“, keďže bola dostupná iba v sade „Legend of Blue-Eyes White Dragon“.
* Karty „Super Secret Rare“ (SSR): Tieto karty boli pôvodne tlačené v obmedzenom množstve a sú veľmi žiadané, najmä zo starších sád.
* Karty „Gold Secret Rare“ (GSR): Tieto karty boli predstavené v sade „Magician's Force“ a sú extrémne vzácne kvôli ich obmedzenému nákladu.
* Karty „Ghost Rare“: Tieto karty boli pôvodne predstavené v sade "Duelist of the Roses" a majú jedinečný holografický efekt. Sú veľmi zberateľské a vzácne.
* Karty "Limited Edition" (LE): Tieto karty boli vytlačené v obmedzenom množstve a často sa rozdávajú na špeciálnych podujatiach alebo turnajoch.
Nakoniec, najvzácnejšia karta Yugioh je tá, ktorú je najťažšie nájsť v dobrom stave a je veľmi vyhľadávaná zberateľmi.