Na druhej strane Shakespeare zobrazuje aj čarodejnice a nadprirodzeno jemnejším a nejednoznačnejším spôsobom. V niektorých jeho dielach sú tieto prvky prezentované ako sily mimo ľudské chápanie, stelesňujúce pozitívne aj negatívne aspekty existencie. Napríklad v Búrke Prospero, právoplatný vojvoda z Milána, používa mágiu, aby sa pomstil a obnovil poriadok, no jeho sily v sebe nesú aj morálnu zložitosť, ktorá odráža jeho protichodné emócie a motivácie.
Shakespearovo zobrazenie čarodejníc a nadprirodzena navyše často slúži ako prostriedok na skúmanie širších tém a myšlienok. V "Macbeth" proroctvá čarodejníc vedú k tragickému pádu hlavnej hrdinky, komentujúc témy ambícií, viny a dôsledkov vlastných činov. Podobne aj v Búrke konflikt medzi Prosperom a jeho bratom Antoniom a magickým svetom, ktorý obýva, vyvoláva otázky o spravodlivosti, odpustení a transformačnej sile lásky a zmierenia.
Celkovo možno povedať, že zatiaľ čo Shakespeare predstavuje čarodejnice a nadprirodzené vo svojich hrách ako potenciálne nebezpečné a rušivé sily, obdarúva ich aj zmyslom pre tajomstvo, fascináciu a zložitosť, necháva priestor na interpretáciu a pozýva divákov, aby uvažovali o hlbších vrstvách ľudskej povahy. , morálka a sily, ktoré formujú ich svet.