Tu sú niektoré z kľúčových objavov a príspevkov Émila Rouxa:
1. Toxín záškrtu :Roux spolu s Alexandrom Yersinom objavili, že baktéria Corynebacterium diphtheriae produkuje toxín, ktorý je zodpovedný za symptómy záškrtu. Tento objav bol významným prelomom v pochopení patogenézy ochorenia.
2. Antitoxín proti záškrtu :Roux a jeho kolega Pierre Paul Émile Roux ďalej demonštrovali, že kone môžu byť imunizované proti záškrtu injekciou toxínu. Zistilo sa, že sérum z imunizovaných koní obsahuje protilátky, ktoré by mohli neutralizovať toxín a chrániť pred infekciou záškrtom. To viedlo k vývoju difterického antitoxínu, prelomovej liečby záškrtu, ktorá výrazne znížila úmrtnosť na toto ochorenie.
3. Pasterizácia :Roux úzko spolupracoval s Louisom Pasteurom, ktorý je známy svojou priekopníckou prácou v oblasti pasterizácie. Roux významne prispel k praktickým aplikáciám pasterizácie, pričom preukázal jej účinnosť pri konzervovaní potravín a prevencii prenosu chorôb mliekom.
4. Filter Roux-Chamberland :Roux spolu so svojím kolegom Charlesom Chamberlandom vyvinul Roux-Chamberland filter, typ keramického filtra, ktorý sa používa na odstránenie baktérií a iných mikroorganizmov z tekutín. Tento filter zohral kľúčovú úlohu v mikrobiologických technikách, čo umožnilo separáciu mikroorganizmov na štúdium a čistenie.
5. Inštitút Pasteur :Roux zohral vplyvnú úlohu pri založení a rozvoji Pasteurovho inštitútu, renomovanej výskumnej inštitúcie v Paríži. Vo funkcii riaditeľa ústavu pôsobil od roku 1895 až do odchodu do dôchodku v roku 1933. Pod jeho vedením sa Pasteurov inštitút stal popredným centrom pre mikrobiológiu, imunológiu a ďalší biomedicínsky výskum.
Rouxove objavy a príspevky výrazne pokročili v oblasti mikrobiológie a mali hlboký vplyv na prevenciu a liečbu infekčných chorôb. Spomína sa na neho ako na priekopníka v bakteriológii a imunológii a jeho práca naďalej ovplyvňuje lekársky výskum a prax.