Útek Siriusa Blacka: Kniha sa otvára správou, že Sirius Black, nebezpečný zločinec a Harryho krstný otec, utiekol z väzenia v Azkabane. Hovorí sa, že Black je po Harrym, čím pridáva novú úroveň strachu do už tak stresujúceho prostredia.
Noví učitelia a tajomný väzeň: Do Rokfortu prichádzajú dvaja noví učitelia:Remus Lupin, učiteľ obrany proti čiernej mágii, a profesorka Trelawneyová, učiteľka veštenia. Medzitým je na hrade zadržiavaný tajomný väzeň, o ktorom sa predpokladá, že je Sirius Black.
Kúzlo Patronus: Harry sa od Remusa Lupina naučí mocné kúzlo Patronus, ktoré mu pomôže poraziť dementorov, strážcov Azkabanu, ktorých priťahuje jeho smútok a strach.
Pravda o Siriusovi Blackovi: Prostredníctvom rôznych indícií a stretnutí Harry objaví pravdu o Siriusovi Blackovi. Bol falošne obvinený zo zrady Harryho rodičov lordovi Voldemortovi a jeho skutočným poslaním bolo chrániť Harryho.
Čeliť pravde: Harry musí čeliť pravde o smrti svojich rodičov a skutočným motívom Siriusa Blacka, ako aj nebezpečenstvu, ktoré pre Harryho predstavuje.
Obracač času: Hermiona používa obracač času, aby sa vrátila v čase a zachránila Siriusa Blacka a Buckbeaka, hipogrifa neprávom odsúdeného na smrť. To vedie k sérii udalostí, ktoré menia priebeh príbehu.
Tvárou v tvár dementorom: Harry, Ron a Hermiona sa postavia skupine dementorov, pričom na svoju obranu použijú kúzlo Patronus.
Skutočná hrozba: Ukázalo sa, že Peter Pettigrew, o ktorom si všetci mysleli, že je mŕtvy, je v skutočnosti nažive a žil v prestrojení za Ronovho potkana Scabbers. Pettigrew je ten, kto zradil Harryho rodičov, nie Sirius Black.
Finále: S odhalenou pravdou a odhaleným skutočným nebezpečenstvom sa Harry, Ron a Hermiona postavia Petrovi Pettigrewovi, čím zachránia Siriusa Blacka. Rok sa končí pocitom úľavy a nového porozumenia.
Kľúčové motívy: Kniha skúma témy zrady, priateľstva, spravodlivosti a konfrontácie s minulosťou. Predstavuje tiež nové postavy, magické bytosti a rozširuje svet mágie.