Filmy:
* Pretty in Pink (1986) :Tento tínedžerský rom-com je pravdepodobne jeho najslávnejšia rola.
* Superman IV:The Quest for Peace (1987) :Hral postavu Lennyho Luthora, syna Lexa Luthora.
* Tri mušketieri (1993) :Komediálny pohľad na klasický príbeh, kde hral Plancheta.
* Žhavé zábery! (1991) a Žhavé zábery! Časť Deux (1993) :Dva parodické filmy s Charliem Sheenom v hlavnej úlohe, kde si Cryer zahral vedľajšiu úlohu.
* Nemý a hlúpejší (1994) :Malá, ale nezabudnuteľná úloha čašníka.
* Len na návšteve (2001) :Francúzsko-americká komédia, kde Cryer hrá stredovekého rytiera.
* The Trouble with Men (2010) :Romantická komédia s hviezdnym hereckým obsadením.
* Hit Man (2012) :Triler o nájomnom vrahovi, ktorý má za úlohu zabiť amerického senátora.
Televízia:
* The Famous Teddy Z (1989-1990) :Jeho prvá hlavná úloha v televíznom sitcome.
* Problémy s Larrym (1993-1994) :Krátkodobá situačná komédia, kde Cryer hral hlavnú postavu.
* Partneri (2011 – 2012) :Hral spolu s Michaelom Uriem v tomto sitcome o partnerstve dvoch právnikov.
* Dva a pol chlapa (2003 – 2015) :Cryerova prelomová rola ako postava Alana Harpera, ktorá mu vyniesla štyri ceny Primetime Emmy za vynikajúceho herca vo vedľajšej úlohe v komediálnom seriáli.
* Mama (2013 – 2021) :V 4. sezóne sa pripojil k obsadeniu tohto sitcomu, kde hral úlohu Adama, milenca Christy (hrá Anna Faris).
* Krstný otec z Harlemu (2019 – súčasnosť) :Cryer hrá úlohu starostu Roberta Wagnera, skorumpovaného starostu New Yorku počas éry zločineckého bossa Bumpyho Johnsona.
Toto je len výber z jeho najvýznamnejších projektov. Jon Cryer sa počas svojej kariéry podieľal na mnohých ďalších filmových a televíznych projektoch. Je to všestranný a talentovaný herec, ktorý dokázal, že je schopný hrať komediálne aj dramatické úlohy.