Moriarty sa prvýkrát predstaví v príbehu „Dobrodružstvo konečného problému“, kde sa ukáže, že je hlavným zločincom za komplexnou sieťou zločinov, ktoré Holmes vyšetruje. Moriarty je opísaný ako „Napoleon zločinu“ a jeho zločinecká organizácia sa rozprestiera po celej Európe. Svoju spravodajskú a kriminálnu sieť využíva na páchanie rôznych trestných činov vrátane vrážd, podvodov a vydierania.
Holmes konfrontuje Moriartyho v dramatickom zúčtovaní pri vodopádoch Reichenbach, kde obaja zdanlivo padajú na smrť. Neskôr sa však ukázalo, že Holmes prežil a Moriartyho telo sa nikdy nenašlo, takže možnosť jeho návratu zostáva otvorená.
V nasledujúcich príbehoch Sherlocka Holmesa je Moriarty spomenutý alebo spomínaný ako stelesnenie zla a zločineckého génia. Je považovaný za najväčšieho Holmesovho protivníka a jeho plány a plány predstavujú pre Holmesove detektívne schopnosti značné výzvy.