Vojna začína, keď Portgas D. Ace, veliteľ druhej divízie Whitebeard Pirates a biologický syn Gola D. Rogera, bývalého pirátskeho kráľa, je zajatý mariňákmi a naplánovaný na popravu. Aceov brat, Monkey D. Luffy, hlavný hrdina seriálu, a jeho posádka, Slamení piráti, sa pokúšajú Acea zachrániť, čo vedie k stretu s mariňákmi.
Ako bitka eskaluje, zapájajú sa do nej mocnejší jednotlivci a skupiny, vrátane troch admirálov námornej pechoty, siedmich morských bojovníkov a dokonca aj bývalých nepriateľov Whitebeard Pirates, ktorí sa rozhodli bojovať po ich boku. Bitka je poznačená intenzívnymi bojmi, zradou a osobnými obeťami, pretože obe strany utrpia ťažké straty.
Paramount War má niekoľko významných dôsledkov pre svet One Piece. Mení pomer síl medzi mariňákmi a pirátskymi posádkami, čo vedie k novej ére pirátstva. Odhaľuje tiež dôležité informácie o histórii a tajomstvách univerza One Piece, vrátane skutočnej povahy Devil Fruits a existencie starovekých zbraní.
Celkovo je Paramount War kľúčovou udalosťou v príbehu One Piece, ktorý formuje budúcnosť série a má trvalé následky na postavy a svet, ktorý obývajú.