* Univerzita v Grazi (Rakúsko): Svoju akademickú kariéru začal ako profesor matematickej fyziky na univerzite v Grazi v roku 1869.
* Viedenská univerzita (Rakúsko): V roku 1873 sa presťahoval na Viedenskú univerzitu, kde zastával funkciu profesora matematickej fyziky.
* Mníchovská univerzita (Nemecko): V roku 1890 prijal profesúru na univerzite v Mníchove.
* Viedenská univerzita (Rakúsko): V roku 1894 sa vrátil na Viedenskú univerzitu ako profesor teoretickej fyziky.
* Univerzita v Lipsku (Nemecko): V roku 1900 sa presťahoval na univerzitu v Lipsku, aby zaujal miesto profesora fyziky.
* Viedenská univerzita (Rakúsko): Nakoniec sa v roku 1902 vrátil na Viedenskú univerzitu, kde zostal až do svojej smrti v roku 1906.
Jeho výskum v oblasti štatistickej mechaniky a vývoj Boltzmannovej rovnice, ktorá popisuje časový vývoj systému častíc, sa z veľkej časti uskutočnil počas jeho pôsobenia v týchto inštitúciách.