Gysiho najdôležitejším dielom bola jeho kniha _Die Articulation des Unterkiefers_ (1908), v ktorej opísal svoje štúdie anatómie a funkcie temporomandibulárneho kĺbu. Vyvinul tiež niekoľko nástrojov a techník na meranie oklúzie a artikulácie, vrátane Gysi Simplex Articulator .
Gysiho práca mala hlboký vplyv na rozvoj zubného lekárstva a je považovaný za jedného z otcov modernej oklúzie a artikulácie.
Tu je zoznam niektorých najdôležitejších diel Alfreda Gysiho:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
* _Die Artikulácia des Unterkiefers_ (1908)
* _Problém artikulácie_ (1910)
* _Učebnica protetickej stomatológie_ (1915)
* _Štúdie o mandibulárnom kĺbe_ (1929)
*_Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Gysiho práca bola preložená do mnohých jazykov a za svoj prínos v zubnom lekárstve získal množstvo ocenení a vyznamenaní. Je považovaný za jednu z najvýznamnejších osobností v histórii stomatológie.