- Brandenburské koncerty č. 1-6, BWV 1046-1051 (c.1721)
- Cello Suites č. 1-6, BWV 1007-1012 (asi 1720-23)
- Dobre temperovaný klavír, Knihy 1 a 2, BWV 846-893 (1722, 1744)
- Goldbergove variácie, BWV 988 (asi 1741-1742)
- omša h mol, BWV 232 (asi 1733-1738)
- Umučenie svätého Matúša, BWV 244 (1727)
- St John Passion, BWV 245 (1724)
- Orchestral Suites č. 1-4, BWV 1066-1069 (asi 1725-30)
- French Suites, BWV 812-817 (cca 1725)
- English Suites, BWV 806-811 (cca 1715)
- Partity pre sólové husle, BWV 1002-1006 (c.1720)
- Sonáty a partity pre sólové husle, BWV 1001-1006 (c.1720)