• Brandenburský koncert č. 2 F dur, BWV 1047:Tento koncert obsahuje výrazný flautový part v prvej a tretej časti.
• Brandenburský koncert č. 4 G dur, BWV 1049:Flauta hrá sólovú úlohu v druhej časti tohto koncertu.
• Orchestrálna suita č. 2 h mol, BWV 1067:Flauta je súčasťou časti „Badinerie“ tejto suity.
• Sonáta pre flautu A dur, BWV 1032:Táto sonáta je špeciálne napísaná pre flautu a čembalo alebo continuo.
• Sonáta pre flautu a continuo e mol, BWV 1034:Ďalšia sonáta s flautou, sprevádzaná continuom.
• Partita pre flautu a mol, BWV 1013:Táto partita pozostáva z niekoľkých tanečných pohybov napísaných pre flautu.
• Kantáty:Bach zahrnul do niektorých svojich cirkevných kantát aj flautové časti, ako napríklad „Jauchzet Gott in allen Landen“, BWV 51 a „Ich armer Mensch, ich Sündenknecht,“ BWV 55.
Toto je len niekoľko príkladov Bachových skladieb, ktoré obsahujú hudbu napísanú pre flauty. Bach sám o sebe nenapísal exkluzívny flautový koncert.