* Rex Goodwin: Vodca Dark Signers a hlavný antagonista série.
* Devack: Prvý Dark Signer, ktorý sa objavil, a bývalý priateľ Yusei Fudo.
* Roman Goodwin: Rexov brat a druhý Dark Signer, ktorý sa objavil.
* Kalinin: Ruský Dark Signer, ktorý využíva temnú kartu na manipuláciu s ostatnými.
* Misty: Záhadná žena, ktorá vystupuje ako piata Dark Signer.
* Z-one: Silná bytosť z budúcnosti, ktorá riadi udalosti seriálu. Technicky nie je Dark Signer, ale má k nim silné spojenie.
* Antinómia: Záhadná postava, ktorá sa objavuje po boku Z-one a je tiež spojená s Dark Signers.
Je dôležité poznamenať, že zatiaľ čo Dark Signers sú primárni antagonisti, Z-one a Antinomy sú zložitejšie postavy s vlastnými motiváciami.