- Symfónie :Haydn skomponoval viac ako 100 symfónií a mnohé z nich sú považované za majstrovské diela klasického obdobia. Medzi jeho najznámejšie symfónie patria:
- Symfónia č. 45, "Zbohom"
- Symfónia č. 60, "Il distratto"
- Symfónia č. 88, "Písmeno V"
- Symfónia č. 92, "Oxford"
- Symfónia č. 94, "Prekvapenie"
- Symfónia č. 101, "Hodiny"
- Symfónia č. 103, "Drumroll"
- Symfónia č. 104, "Londýn"
- Sláčikové kvartetá :Haydn tiež zložil viac ako 80 sláčikových kvartet, ktoré sú považované za jedny z najlepších príkladov tohto žánru. Medzi jeho najznámejšie sláčikové kvartetá patria:
- Sláčikové kvarteto G dur, op. 76, č. 1
- Sláčikové kvarteto C dur, op. 76, č. 3 („cisár“)
- Sláčikové kvarteto f mol op. 20, č. 5
- Sláčikové kvarteto g mol op. 74, č. 3 ("Jazdec")
- Sláčikové kvarteto d mol, op. 76, č. 2 ("Quinten")
- Sláčikové kvarteto B dur, op. 76, č. 4 ("východ slnka")
- Klavírne sonáty :Haydn skomponoval vyše 50 klavírnych sonát, ktoré sú charakteristické svojou eleganciou a vtipom. Medzi jeho najznámejšie klavírne sonáty patria:
- Klavírna sonáta C dur, Hob. XVI:50
- Klavírna sonáta D dur, Hob. XVI:24
- Klavírna sonáta E-dur, Hob. XVI:49
- Klavírna sonáta F dur, Hob. XVI:23
- Klavírna sonáta G dur, Hob. XVI:40
- Koncerty :Haydn skomponoval množstvo koncertov pre rôzne nástroje, vrátane husľových koncertov, violončelových koncertov a klavírnych koncertov. Medzi jeho najznámejšie koncerty patria:
- Husľový koncert G dur, Hob. VIIa:4
- Violončelový koncert C dur, Hob. VIIb:1
- Klavírny koncert D dur, Hob. XVIII:11
- Klavírny koncert B dur, Hob. XVIII:13
- Oratóriá :Haydn skomponoval aj niekoľko oratórií, ktoré sú rozsiahlymi zborovými dielami s náboženskými textami. Medzi jeho najznámejšie oratóriá patria:
- Stvorenie
- Ročné obdobia
- Il ritorno di Tobia