1. Jednoduchosť a jednoduchosť implementácie. Monoalfabetické šifry sa vytvárajú a implementujú pomerne jednoducho a vyžadujú iba mapovanie písmen v otvorenom texte na písmená v šifrovom texte. Táto jednoduchosť ich sprístupňuje širokému okruhu používateľov, vrátane bežných používateľov a jednotlivcov bez rozsiahlych kryptografických znalostí.
2. Odolnosť voči útokom hrubou silou. Útoky hrubou silou, ktoré zahŕňajú systematické skúšanie všetkých možných kľúčov, môžu byť pre zložitejšie šifry výpočtovo náročné. V prípade monoalfabetických šifier je však počet možných kľúčov obmedzený počtom použitých znakov (t. j. abecedy). Vďaka tomu sú útoky hrubou silou uskutočniteľnejšie, ale stále náročné pre veľké abecedy alebo dlhšie klávesy.
3. Vhodnosť pre určité aplikácie. Monoalfabetické šifry sú obzvlášť vhodné pre aplikácie s nízkou úrovňou zabezpečenia, ako je ukrývanie tajných správ v rámci bežnej komunikácie, osobných denníkov alebo nekritických dokumentov. Vďaka ich jednoduchosti a jednoduchosti použitia sú v týchto scenároch praktické.
Je dôležité poznamenať, že monoalfabetické šifry sú podľa moderných kryptografických štandardov všeobecne považované za slabé. Na zabezpečenie citlivých informácií sa vo všeobecnosti uprednostňujú robustnejšie šifrovacie techniky, ako sú polyalfabetické šifry a moderné kryptografické algoritmy ako AES.