* The Short-Timers (1990) :Hrá postavu zvanú "Kapitán" v tejto čiernej komédii o skupine vojakov umiestnených na Filipínach.
* Drakula Brama Stokera (1992) :Hrá rolu Renfielda, psychicky narušeného pacienta grófa Draculu. Bola to pre neho významnejšia úloha.
* Balada o malej Jo (1993) :V tejto západnej dráme stvárňuje tajomnú postavu nazývanú "Kazateľ".
* Mystery Men (1999) :V tejto superhrdinskej komédii má hlavnú úlohu ako "The Sweeper".
* Veľká ryba (2003) :Hrá "Čarodejnicu" vo fantasy filme Tima Burtona.
Stojí za zmienku, že Tom Waits je známy predovšetkým svojou hudobnou kariérou a objavil sa len v niekoľkých filmoch. Má tendenciu vyberať si úlohy, ktoré sú temné, výstredné alebo inak nekonvenčné.