Dobro vs. zlo: Toto je najzrejmejšia téma, keďže príbeh sa točí okolo bitky medzi Harrym Potterom a Lordom Voldemortom. Téma však presahuje rámec jednoduchej dvojhviezdy. Príbeh skúma povahu dobra a zla, šedé oblasti, ktoré medzi nimi existujú, a potenciál oboch v rámci jednotlivcov.
Láska a priateľstvo: Sila lásky je ústredným prvkom príbehu a ukazuje sa, že je silnejšia než akákoľvek mágia alebo zlo. Harryho láska k priateľom a rodine mu pomáha prekonávať výzvy a nakoniec poraziť Voldemorta. Zdôrazňuje sa aj priateľstvo, pretože Harryho puto s Ronom a Hermionou je nevyhnutné pre jeho úspech.
Odvaha a statočnosť: Harry a jeho priatelia čelia v celej sérii nespočetným nebezpečenstvám a musia neustále naberať odvahu, aby ich prekonali. Príbeh oslavuje statočnosť a odolnosť a ukazuje, že aj obyčajní ľudia môžu dosiahnuť mimoriadne veci, keď čelia svojmu strachu.
Význam možností: Harryho život je neustále definovaný rozhodnutiami, ktoré robí, veľkými aj malými. Príbeh vyzdvihuje silu individuálnych rozhodnutí a zodpovednosť, ktorá je s nimi spojená.
Sila viery: Príbeh zdôrazňuje dôležitosť viery v seba a svoje schopnosti. Harryho viera vo vlastný potenciál a viera ostatných v neho mu umožňuje dosiahnuť veľké veci.
Prijatie smrti: Smrť je opakujúcou sa témou v celej sérii a príbeh skúma jej rôzne aspekty. Učí nás prijať smrť ako prirodzenú súčasť života a nájsť zmysel života aj napriek strate.
Predsudky a diskriminácia: Séria sa zaoberá témami predsudkov a diskriminácie, najmä prostredníctvom zaobchádzania s domácimi škriatkami a inými magickými bytosťami. Zdôrazňuje dôležitosť boja za rovnosť a spravodlivosť pre všetkých.
Povaha rodiny: Harryho hľadanie rodiny a jeho túžba po spolupatričnosti sú významnými témami série. Príbeh skúma rôzne formy rodiny, krvnej aj vyvolenej, a dôležitosť lásky a podpory.
Zatiaľ čo toto sú niektoré z hlavných tém, existuje mnoho ďalších, ktoré prispievajú k hĺbke a zložitosti vesmíru Harryho Pottera. Séria pozýva čitateľov, aby preskúmali tieto témy vlastným spôsobom a našli zmysel a rezonanciu v príbehu.