Sadaova manželka Hana je spočiatku skeptická k ich rozhodnutiu poskytnúť útočisko pilotovi, pretože sa obáva následkov, ak sa ich tajomstvo odhalí. Ako sa však stretáva s Homerom, začína ho vnímať skôr ako jednotlivca než ako nepriateľa a začína byť sympatizujúca s jeho ťažkou situáciou.
Sadao čelí etickému konfliktu medzi lojalitou k svojej krajine a osobnými hodnotami. Uvedomuje si dôležitosť svojej úlohy lekára, no zároveň si uvedomuje, že pomoc nepriateľovi môže mať vážne následky pre neho a jeho rodinu. Hanina podpora a pochopenie mu dodávajú odvahu pokračovať v diskrétnom zaobchádzaní s Homerom a spoločne pracujú na tom, aby ho ukryli pred úradmi.
Ako sa príbeh odvíja, vzťah Sadaa a Hany s Homerom sa prehlbuje. Rozvinú si zmysel pre kamarátstvo a Homer sa prostredníctvom ich interakcií dozvie o japonskej kultúre a tradíciách. Prítomnosť pilota sa v ich domácnosti stáva zdrojom napätia, pretože žijú v neustálom strachu z odhalenia.
Vyvrcholenie príbehu nastáva, keď vojenská polícia vykoná prehliadku kliniky a hľadá nezvestného amerického pilota. Sadao a Hana dokážu prekabátiť úrady, úspešne utajiť Homera a udržať svoje tajomstvo v bezpečí.
Na konci Sadao a Hana premýšľajú o svojich skúsenostiach a uvedomujú si dôležitosť súcitu a ľudskosti v časoch konfliktov. Chápu, že ich rozhodnutie pomôcť Homerovi im dalo cenné lekcie o predsudkoch, empatii a sile medziľudských vzťahov.
„Nepriateľ“ skúma témy morálnej zodpovednosti, kultúrneho porozumenia a vplyvu vojny na jednotlivcov. Spochybňuje predstavu nepriateľa ako entity bez tváre a zdôrazňuje zložitosť ľudských vzťahov uprostred spoločenských konfliktov.