Na druhej strane však kapela občas čelila aj negatívnej mediálnej pozornosti a kritike. Bolo to spôsobené rôznymi faktormi, vrátane ich osobných sporov a konfliktov, ich údajného užívania drog a divokého životného štýlu a ich politického aktivizmu. Médiá sa často zameriavali skôr na tieto kontroverzie ako na ich hudbu, čo viedlo k verejnej kontrole a negatívnej tlači. Navyše ich povesť trochu pošramotili rozpady kapely a následné opätovné stretnutia, ktoré niektorí kritici vnímali ako oportunistické a poháňané finančnými motívmi.
Napriek týmto výzvam zostáva odkaz Crosbyho, Stillsa, Nasha a Younga silný a ich hudba je dodnes vplyvná. Mnohí fanúšikovia a kritici si ich stále radi pamätajú za ich hudobný prínos a kultúrny vplyv. Ich odkaz v rockovej hudbe a kontrakultúre 60. rokov zostáva nezmenšený a stále sú často oslavovaní ako ikonická hudobná skupina.