Argumenty pre kanonickosť:
* Vytvoril Gene Roddenberry: TAS bol priamo pod dohľadom a schválený Gene Roddenberry, tvorcom Star Treku, a jeho cieľom bolo zostať verné duchu pôvodnej série.
* Oficiálna kontinuita: Po mnoho rokov bol TAS považovaný za kánon spoločnosťou Paramount a autori nasledujúcich seriálov často odkazovali alebo stavali na prvkoch z animovaných seriálov.
* Prvky príbehu: TAS zaviedla mnoho prvkov, ktoré boli neskôr prijaté do živej akčnej série, vrátane Tribbles, planéty Vulcan a určitých postáv, ako sú Makisti.
Argumenty proti kanonike:
* Iný tón a štýl: Štýl animácie a rozprávanie v TAS sa výrazne líšili od živých akčných programov, niekedy sa prikláňali k náladovejšiemu a komediálnemu tónu.
* Rozpory: Niektoré prvky v TAS sú v rozpore s neskorším kánonom, ako napríklad Spockova emocionálna kontrola je v animovaných seriáloch obmedzenejšia.
* Nezrovnalosti: Medzi TAS a následnými živými vystúpeniami existovali nezrovnalosti v technológii a tradícii.
Aktuálny stav:
Zatiaľ čo TAS bol v minulosti považovaný za kánon, fanúšikovia Star Treku a dokonca aj spisovatelia čoraz viac akceptovali, že TAS nie je striktne kánon . Je to hlavne kvôli nezrovnalostiam a vývoju vesmíru Star Trek cez neskoršie série a filmy.
Často sa teraz zobrazuje takto:
* Uvoľnený Canon: TAS možno považovať za súčasť „vesmíru“ Star Treku a možno si ho vychutnať ako doplnkový kúsok celkového príbehu.
* Inšpirácia: Mnohé prvky TAS sa považujú za inšpiratívne a ovplyvňujú nasledujúci kánon, ale nie nevyhnutne priamo kanonické.
V konečnom dôsledku je rozhodnutie, či zvážiť kánon TAS, na individuálnom divákovi. Je to skvelá séria sama o sebe a ponúka jedinečný pohľad na svet Star Trek.