Skorá kariéra:
* Breaking the Waves (1996): Jej prelomová rola jej priniesla nomináciu na Oscara za najlepšiu herečku.
* Hilary a Jackie (1998): Stvárnila skvelú, no problémovú huslistku Jacqueline du Pré.
* The Boxer (1997): Romantická dráma odohrávajúca sa v Severnom Írsku.
* Angelin popol (1999): Hrala matku v tejto adaptácii spomienok Franka McCourta.
Neskoršia kariéra:
* Červený drak (2002): Thriller podľa románu Thomasa Harrisa.
* Život a smrť Petra Sellersa (2004): Hrala manželku Petra Sellersa.
* Vojna svetov (2005): Sci-fi film s Tomom Cruisom v hlavnej úlohe.
* Dievča v kaviarni (2005): Politická dráma odohrávajúca sa v Bruseli.
* Tajný život včiel (2008): Dráma o mladom dievčati, ktoré uteká za mamou.
* Zlodejka kníh (2013): Historická dráma o mladom dievčati v nacistickom Nemecku.
* Everest (2015): Hral úlohu Helen Wilton.
* The Lighthouse (2019): Psychologický horor s Willemom Dafoeom.
* Elektrický život Louisa Waina (2021): Hral postavu Emily Richardson.
* The King's Man (2021): Prequel k filmovej sérii Kingsman.
Ďalšie významné filmy:
* The Escapist (2008): Kriminálna dráma.
* Anna Karenina (2012): Filmové spracovanie románu Leva Tolstého.
* Môj týždeň s Marilyn (2011): Životopisná dráma o Marilyn Monroe.
* Stratená dcéra (2021): Psychologická dráma s Oliviou Colman v hlavnej úlohe.
Toto je len ukážka pôsobivej filmografie Emily Watsonovej. Naďalej je aktívnou a uznávanou herečkou s mnohými ďalšími projektmi.