Filmy:
* Ružové plameniaky (1972): Waters hral úlohu "Božského" v tomto kultovom klasickom filme.
* Zúfalý život (1977): V tomto filme sa objavil aj ako „Božský“.
* Polyester (1981): Waters hral úlohu "The Divine" a tiež režíroval tento film.
* Lak na vlasy (1988): Waters mal v tomto filme portrét ako predavač v obchode s platňami.
* Cry-Baby (1990): Nakrátko vystúpil ako riaditeľ školy.
* Sériová mama (1994): Waters hral v tomto filme rolu "The Divine".
* Pecker (1998): V tomto filme sa opäť objavil ako "The Divine".
* Špinavá hanba (2004): Waters hral v tomto filme rolu "The Divine".
* This Filthy World (2006): Objavil sa v tomto dokumente o svojom živote a práci.
* Fruitvale Station (2013): Waters sa objavil ako spravodajský reportér.
* Dom, ktorý postavil Jack (2018): Waters hral v tomto filme Larsa von Triera malú rolu.
Televízia:
* Simpsonovci (1991): Waters sa vyjadril v epizóde „Homer Defined“.
* South Park (1997): Vyjadril sa aj v epizóde „Chef Aid“.
* The Sopranos (2001): Waters mal portrét ako filmový režisér v epizóde „Modrá kométa“.
* Zastavený vývoj (2003): Mal malú úlohu v epizóde „Nepoškvrnené voľby“.
* The Larry Sanders Show (1992 – 1998): Waters sa v tejto šou niekoľkokrát objavil ako on.
* Škaredá Betty (2006 – 2010): Objavil sa ako sám v epizóde „Svet škaredej Betty“.
* RuPaul's Drag Race (2010 – doteraz): Waters sa v tejto šou objavil ako hosťujúci porotca.
Zatiaľ čo jeho účinkovanie v iných projektoch je obmedzené, John Waters sa najviac preslávil svojimi vlastnými jedinečnými a vplyvnými filmami.