1. Zložitosť spracovania: Kodachróm vyžadoval komplexný, viacstupňový a časovo náročný postup spracovania, ktorý by sa dali vykonať iba špecializovanými laboratóriami. Tento obmedzený prístup a zvýšené náklady na vývoj filmu.
2. Citlivosť: Skorý kodachróm bol relatívne pomalý (nízky ISO), čo sťažovalo strieľať v podmienkach nízkeho osvetlenia bez použitia statívu alebo blesku. V určitých situáciách to obmedzilo jeho univerzálnosť.
3. Rovnováha farieb: Rovnováha farieb spoločnosti Kodachrome bola dosť citlivá na typ použitého svetla. Zatiaľ čo film bol navrhnutý na denné svetlo, pri používaní s umelými zdrojmi svetla by mohol produkovať nepresné farby.
4. Zrno: Kodachróm, najmä predchádzajúce verzie, by mohol vykazovať výrazné zrno, najmä pri vyšších ISO. To obmedzilo schopnosť filmu vytvárať jemnozrnné a podrobné obrázky.
5. Fidelity farby: Zatiaľ čo Kodachrome bol známy svojím presným farbným stvárnením, nebolo vždy dokonalé. Prvé verzie niekedy zápasili s reprodukciou určitých farieb, najmä tónov pleti, ktoré by sa mohli javiť príliš červenkasté.
6. Dostupnosť: Kodachróm nebol vždy ľahko dostupný vo všetkých formátoch a veľkostiach, čo by mohlo obmedziť jeho použitie pre určité typy fotografií.
7. Cena: V porovnaní s inými farebnými filmami svojej doby bol Kodachrome výrazne drahší. To by mohlo byť prekážkou pre fotografov s vedomím rozpočtu.
8. Obmedzená zemepisná šírka: Kodachróm mal relatívne úzku šírku expozície, čo znamená, že bola náchylnejšia na nadmerné a nedostatočné. To si vyžadovalo presnejšie kontrolu expozície a obmedzilo tvorivú slobodu fotografov.
9. Životnosť na trvanlivosť: Zatiaľ čo spoločnosť Kodachrome bola známa svojou výnimočnou stabilitou archivácie, mala obmedzenú trvanlivosť. To znamenalo, že ukladanie filmu na dlhšiu dobu by mohlo znížiť jeho kvalitu.
10. Obmedzené farebné gamut: V porovnaní s modernými digitálnymi fotoaparátmi a niektorými ďalšími filmovými zásobami bola farebná škála spoločnosti Kodachrome obmedzenejšia. To znamenalo, že určité farby sa nedajú reprodukovať presne.
Tieto nevýhody sa postupne riešili zlepšeniami formulácie a výrobného procesu filmu. Niektoré z týchto charakteristík si však zachovali aj neskoršie verzie Kodachrome.